尿路感染是由细菌入侵泌尿系统引起的，其中95％的尿路感染是由单一细菌引起，最常见的致病菌是大肠埃希菌。此外，变形杆菌、产气杆菌、克雷伯肺炎杆菌、铜绿假单胞杆菌、白色念珠菌、金黄色葡萄球菌都可导致尿路感染。
长期留置导尿（即在导尿后，将导尿管保留在膀胱内）、长期服用糖皮质激素或免疫抑制药物、神经源性膀胱、结石、先天性发育畸形、尿道瘘等都是尿路感染的高危因素。