可以辞职，《劳动仲裁法》第二十七条劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。

申请劳动仲裁期间，员工可以离职，劳动仲裁跟员工是否在职无关，只要仲裁有效的时限内提出劳动仲裁就可以的。需要注意的是劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。